I. Подзона хвойных и широколиственных лесов маньчжурского типа: Поймы рек и нижние части южных склонов в южной части национального парка занимает пояс дубовых лесов, который распространен по высоте от 150 до 600 м над уровнем моря. В целом для территории национального парка они не характерны – здесь проходит южный край их распространения. Формации дубовых лесов образуют разнообразные ассоциации приуроченные к различным формам рельефа. В целом данные растительные сообщества являются вторичными, образовавшимися в результате воздействия выборочных рубок и лесных пожаров. В южной части территории национального парка интенсивные рубки проводились лишь на подножье г.Сестра (Лазовский район), где леса трансформированы человеком. Именно здесь преобладают формации дубовых лесов. В северной части парка дубовые леса отсутствуют. В дубовых лесах произрастает ряд редких видов, занесенных в красную книгу. Среди них можно встретить изящное растение, с большими, буро-бордовыми поникающими колокольчиковидными цветами. Это-рябчик уссурийский. Долина реки Милоградовки – одно из основных мест Приморского края где сохранились вековые никогда не рубленные и не горевшие кедрово-широколиственные леса. Здесь широко представлены типичные представители маньчжурской флоры: лещина маньчжурская, элеутерококк колючий, леспедеца двухцветная, жимолость горбатая, чубушник тонколистный, клены — ложнозибольдов и бородчатый. Также единично встречается груша уссурийская, диморфант и вишня железистая, занесенная в красную книгу. Из лиан наиболее характерны лимонник китайский, виноград амурский, актинидия коломикта и занесенная в красную книгу актинидия острая. Все они обильно плодоносят как вкусными, так и полезными ягодами. Кроме того, здесь произрастают спутники хвойно-широколиственных и широколиственных лесов — фрима тонкокистевая, василистник нитчатый, зеленоцвет японский, осоки — уссурийская, ланцетная и ржавопятнистая и неомолиния маньчжурская, а также множество редких травянистых растений, занесенных в красную книгу: симплокарпус раскрытолистный пиррозия язычковая, папоротники: плаунок тамариксолистный и конниограмма средняя, борец сихотинский, пыльцеголовник прицветниковый, соссюрея блестящая и шлемник байкальский. Чем выше по склонам, тем чаще встречаются ель аянская и пихта белокорая. Переходный пояс кедровых и кедрово-еловых лесов расположен в основном на высотных отметках 500-700 м над уровнем моря. Он представлен видами как маньчжурской так и охотской флоры, при их взаимном участии. Для него характерны кедрово-еловые леса с равномерным участием темнохвойных и кедра. Помимо кедра, ели аянской и пихты белокорой, здесь произрастают липа амурская, клен мелколистный, ильм лопастной, желтая береза и др. Также здесь встречается удивительное, редкое, лекарственное хвойное растение-тис остроконечный. Здесь он может достигать возраста 3 – 5 тысяч лет. В подлеске преобладают кустарниковые виды кленов: желтый, бородчатый и зеленокорый. Небольшие сомкнутые куртины образует лещина маньчжурская. Встречается и красивоцветущие кустарники, такие как сирень Вольфа, занесенная в Красную книгу. В травяном покрове фон образуют папоротники: щитовник амурский и Буша, деннштедтия Вильфорда, пиррозия язычковая, также занесенные в красную книгу, а также представители мелкотравья: кислица обыкновенная, мителла голая и майник двулистный. Среди трявянистых можно встретить и другие редкие и красивоцветущие растения: подмаренник удивительный, ореорхис раскидистый, II. Подзона хвойных лесов охотского типа Пояс пихтово-еловых лесов расположен между отметками 600-800 до 1100-1200 м над уровнем моря. На территории национального парка они распространены в основном в бассейне реки Уссури. Если кедрово-еловые леса здесь получили весьма ограниченное распространение, то пихтово-еловые занимают около 70% площади Северного участка. В составе этих лесов с высоты 900 м над уровнем моря почти не встречаются представители маньчжурской флоры. Стволы хвойных здесь покрыты эпифитными мхами, а с крон свисают лишайники, такие как уснея бородатая. В травяном ярусе здесь также растет много видов, занесенных в Красную книгу, таких как: надбородник безлистный, растущий под толщей мхов и выносящий на поверхность лишь стебель с цветами, Пояс высокогорных пихтово-еловых и каменно-березовых лесов расположен от высотных отметок 1000-1300 м над уровнем моря до верхней границы леса, окаймляющей безлесные вершины гор. В отличие от нижерасположенного пояса пихтово-еловых лесов, где распространен моховой покров, здесь преобладает травяной покров. В высокогорных лесах встречается множество редких растений, занесенных в Красную книгу, среди них абелия корейская, распускающая в период цветения душистые цветы; поповиокодония узкоплодная, калипсо клубневая. Во всех отмеченных поясах встречаются формации лиственничных лесов c участием двух видов рода лиственница: ольгинская и Комарова. Они образуют характерные для каждого пояса насаждения от долинных лиственничников по песчаным речным отложениям, до высокогорных лиственничников, произрастающих у верхней границы лесов, но ни в одном из поясов они не занимают доминирующего положения. Одновременно на мари долины р.Низменка (урочище Мута) лиственница местами образует однородные леса, где отсутствуют другие виды деревьев.